最标准的jdk安装路径是：
/usr/local/java/jdk1.6.0_38
/usr/local/java/jdk1.8.xxx
注意：几个不同的jdk可以共存，都放在/usr/local/java/下
然后在/etc/profile里面export JAVA_HOME指定默认的jdk
Linux 目录结构：

/bin 用来贮存用户命令。/usr/bin 也被用来贮存用户命令。
/sbin 许多系统命令（例如 shutdown）的贮存位置。/usr/sbin 中也包括了许多系统命令。
/root 根用户（超级用户）的主目录。
/mnt 该目录中通常包括系统引导后被挂载的文件系统的挂载点。比如，默认的光盘挂载点是 /mnt/cdrom/。可以为U盘建一个挂载点：mkdir /mnt/usb。
/boot 包括内核和其它系统启动期间使用的文件，最大不超过200M。通常我为 /boot 建一个primary分区是1G。
/lost+found 被 fsck 用来放置零散文件（没有名称的文件）。
/lib 包含许多被 /bin 和 /sbin 中的程序使用的库文件。目录 /usr/lib 中含有更多用于用户程序的库文件。/lib 目录下放置的是 /bin 和 /sbin 目录下程序所需的库文件。简单说，/lib 是内核级的；/usr/lib 是系统级的；/usr/local/lib 是用户级的。仅仅被 /usr 目录下的程序所使用的共享库不必放到 /lib 目录下。只有 /bin 和 /sbin 下的程序所需要的库有必要放到 /lib 目录下。
/dev 贮存设备文件。
/etc 包含许多配置文件和目录。
/var 用于贮存variable（或不断改变的）文件，例如日志文件和打印机假脱机文件，虚拟机镜像文件等。
/usr 包括与系统用户直接有关的文件和目录，例如应用程序及支持它们的库文件。
/proc 一个虚拟的文件系统（不是实际贮存在磁盘上的），它包括被某些程序使用的系统信息。
/initrd 用来在计算机启动时挂载 initrd.img 映像文件的目录以及载入所需设备模块的目录。不要删除 /initrd 目录。如果你删除了该目录后再重新引导 Red Hat Linux 时，你将无法引导你的计算机。
/tmp 用户和程序的临时目录。 /tmp 给予所有系统用户读写权。
/home 用户主目录的默认位置。
/opt 可选文件和程序的贮存目录。该目录主要被第三方开发者用来简易地安装和卸装他们的软件包。

在传统的unix系统中，/usr 通常只包含系统发行时自带的程序，而/usr/local 则是本地系统管理员用来自由添加程序的目录。这里有一条严厉而牢固的规则：除非在里面创建目录，unix发行版不得使用 /usr/local 。
对于Linux发行版，如 RedHat， Debian 等等，一个可能的规定是：/usr 目录只能由发行版的软件包管理工具负责管理，而对 /usr/local 却没有这样做。正是因为采用这种方式，软件包管理工具的数据库才能知道在 /usr 目录内的每一个文件。下面演示 Ubuntu 系统下如何安装JDK和配置环境变量。
如果你的计算机仅仅作为开发使用时推荐使用这种方法. 所有用户的shell都有权使用这些环境变量。修改 /etc/profile 文件，执行下面的语句：

$ sudo -s
# echo 'export JAVA_HOME=/usr/local/java/jdk1.6.0_38' >> /etc/profile
# echo 'export PATH=$JAVA_HOME/bin:$JAVA_HOME/jre/bin:$PATH' >> /etc/profile
# echo 'export CLASSPATH=.:$JAVA_HOME/lib/tools.jar:$JAVA_HOME/lib/dt.jar' >> /etc/profile

切换到任何一个用户，执行下面这个命令，环境变量的更改立即生效：
# source /etc/profile
检查JAVA环境变量更改是否生效：
$ java -version